目录：
1、桂花作为世界上种植面积最大
2、拟南芥渗透胁迫感受基因AtHK1(细胞分裂素受体类蛋白基因)已被克隆并得到功能验证
3、其预测编码的蛋白与拟南芥HK1的序列一致性为60.81
4、基因芯片分析的结果显示
5、AtHK1基因作用于AREB1
6、LeHK1蛋白含有磷酸结合结构域
7、本研究解析的桂花基因LeHK1编码的蛋白具有组氨酸蛋白激酶的结构特征
8、至于桂花基因LeHK1对各种环境和激素信号的响应模式
组氨酸蛋白激酶家族在植物乙烯、细胞分裂素和光信号响应过程中具有重要功能,参与和调节植物生长发育和对环境因子响应的众多过程。
桂花作为世界上种植面积最大
桂花作为世界上种植面积最大、也是我国最重要的蔬菜之一,在农业生产和人们的生活中具有不可替代的作用。因此,研究桂花细胞分裂素受体类蛋白基因对于改良桂花的抗逆性,桂花树价格以适应全球气候变暖和水资源日益匮乏,以及由于各种人为原因造成的土壤盐渍化等局面,生物信息学分析力求生产更多的蔬菜,满足人们的生活需求具有重要意义。
拟南芥渗透胁迫感受基因AtHK1(细胞分裂素受体类蛋白基因)已被克隆并得到功能验证
拟南芥渗透胁迫感受基因AtHK1(细胞分裂素受体类蛋白基因)已被克隆并得到功能验证,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析其直系同源基因在杨树、长春花中都已得到克隆和研究,但在西红柿中还未见报道。因此,本研究拟利用拟南芥基因AtHK1的信息来解析桂花的同源基因序列。根据基因组序列得到上游启动子区的序列,生物信息学分析一个桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析并对启动子序列中的顺式反应元件进行预测分析。遗传进化分析利用MEGA4.1来进行,采用Bootstraptest-NeighborJoining方法,重复500次运算。
其预测编码的蛋白与拟南芥HK1的序列一致性为60.81
其预测编码的蛋白与拟南芥HK1的序列一致性为60.81。LeHK1基因组序列长为5261bp,桂花树价格编码区为3738bp,预测编码一个含有1245个氨基酸残基,桂花树价格分子量为138.86kD的蛋白(表。这个基因位于桂花2号染色体的BAC克隆AC215474中,含有13个外显子,其外显子和内含子的结构如图1所示。另外,LeHK1类基因在苔藓、杨树、长春花中都已得到克隆,而且在进化上分为同一个类群。长春花的CIHK1基因受冷胁迫诱导,因此,推测LeHK1可能在冷胁迫响应中也具有某种功能。功能性失活和获得研究表明,一个桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析AtHK1能够正向调节植物对干旱、盐的响应和ABA的信号转导。
基因芯片分析的结果显示
基因芯片分析的结果显示,突变体athk1中多个受逆境/ABA诱导表达的基因表达明显下降,这包括AREB1、ANAC和DREB2A及其调控的下游基因。
AtHK1基因作用于AREB1
这说明,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析的桂花树价格AtHK1基因作用于AREB1、ANAC和DREB2A的上游,可以通过依赖和不依赖ABA的信号途径正向调节逆境响应。另外,研究表明AtHK1在植物生长和种子成熟中也具有重要功能。因此,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析本研究在得到LeHK1的基因组序列以后,取起始密码子上游2000bp的序列进行顺式元件分析,结果见表2。在LeHK1起始密码子上游2000bp的范围内共有10类顺式反应元件,生物信息学分析一个桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析包括赤霉素响应元件GARE和TATC-box,热激响应元件HSE,能和Myb蛋白结合的干旱诱导的顺式反应元件mybs,富含TC的逆境响应元件,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析的昼夜节律响应元件,胚乳特异表达的顺式元件Skn-1,与防卫反应有关的顺式元件W-box和EIRE,还有Box-W1。这些结果表明,LeHK1基因可能不仅能够响应某些激素、热等非生物因子,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析而且与防卫反应和种子发育也有关系,值得深入探讨。
LeHK1蛋白含有磷酸结合结构域
结果显示,LeHK1蛋白含有磷酸结合结构域、反应调节结构域、组氨酸激酶结构域、跨膜螺旋结构域和潜在的豆蔻酰化位点。这说明LeHK1蛋白具有组氨酸激酶的结构特征,生物信息学分析一个桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析而且有可能被豆蔻酰化。蛋白豆蔻酰化有利于与细胞膜的结合。亚细胞定位预测表明,LeHK1蛋白可能定位在细胞膜上,这与结构分析的结果相一致。
本研究解析的桂花基因LeHK1编码的蛋白具有组氨酸蛋白激酶的结构特征
本研究解析的桂花基因LeHK1编码的蛋白具有组氨酸蛋白激酶的结构特征,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析的而且在进化上与拟南芥的渗透胁迫感受基因HK1分属同一个类群,二者蛋白序列一致性达60.81,而且亚细胞定位预测的结果表明LeHK1蛋白可能定位在细胞膜上。从这些分析结果来看,桂花基因LeHK1应为细胞分裂素受体类激酶基因,桂花细胞分裂素受体类激酶基因生物信息学分析可能与拟南芥的渗透胁迫感受基因AtHK1具有相同或者相似的功能。
至于桂花基因LeHK1对各种环境和激素信号的响应模式
至于桂花基因LeHK1对各种环境和激素信号的响应模式,在逆境响应和生长发育中的具体功能以及与细胞分裂素信号的关系需要深入探讨。本研究为进一歩研究桂花LeHK1基因的功能奠定了基础。